A base do SIGA-SC se organizar nos locais de trabalho, estudo e moradia, por meio das seções que reúnem militantes de um mesmo ramo. Atualmente o SIGA-SC possui três seções:
• Seção estudantil, que reúne estudantes de todos os níveis de ensino, de instituições públicas e privadas.
• Seção popular, que reúne militantes do movimento popular, comunitário e de bairro.
• Seção de trabalhadores da educação, que reúne os profissionais da educação de todas as redes e de todos os ofícios (professor, cozinheira, faxineira, etc).
